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荧光定量PCR仪在食品安全与检疫物种鉴定中的应用研究


更新时间:2025/10/24 文章来源:今发布网 浏览:44 编辑:boqinglab 搜索看看


食品安全与动植物检疫是保障公众健康、维护生态安全的关键环节。近年来,食品市场中“牛肉掺马肉”“羊肉掺鸭肉”“名贵中药材以伪代真”等物种掺假问题频发,不仅损害消费者权益,还可能引发过敏、食源性疾病等风险;同时,外来物种入侵(如红火蚁、假高粱)及疫病载体物种(如携带禽流感病毒的野禽)的快速识别,也对检疫检测的时效性与准确性提出更高要求。

传统物种鉴定方法存在明显局限:形态学鉴定依赖专业经验,无法识别破碎、加工后的样本;普通PCR需电泳验证,操作繁琐且无法定量;进口荧光定量PCR仪则存在成本高、售后响应慢等问题。博清生物科技(南京)有限公司作为国产仪器代表,其研发的荧光定量PCR仪具有高性价比、适配国产试剂、操作便捷等特点。本研究通过建立标准化检测体系,系统验证该仪器在物种鉴定中的性能,为其推广应用提供科研依据。

一、材料与方法

(一)实验材料

1、样本来源:实验用牛肉、猪肉、羊肉、鸡肉、三文鱼、鳕鱼、西洋参、人参等样本均采自当地农贸市场;检疫截留样本(疑似携带外来物种卵的木材、进口冻品)由当地海关提供。

2、试剂:动物基因组DNA提取试剂盒、植物基因组DNA提取试剂盒、2×TaqMan® Probe qPCR Mix、目标物种特异性引物与探针。

3、仪器:博清生物荧光定量PCR仪、超微量分光光度计、高速离心机。

(二)实验方法

1、样本前处理与DNA提取

肉类/水产品样本:取50mg组织,经液氮研磨后,用动物基因组DNA提取试剂盒提取总DNA,操作严格遵循试剂盒说明书。

中药材样本:取100mg粉末,用植物基因组DNA提取试剂盒去除多糖、多酚干扰,提取总DNA。

检疫样本:木材样本刮取表面粉末,冻品样本取100mg组织,按对应试剂盒提取DNA。

用超微量分光光度计检测DNA纯度(A260/A280值1.8~2.0为合格)与浓度,并用无酶水稀释至100ng/μL备用。

2、引物与探针设计

以物种保守基因序列为靶点,通过NCBI数据库比对,设计特异性引物与TaqMan探针,确保仅对目标物种产生荧光信号,无交叉反应。

3、qPCR反应体系与程序

反应体系(20μL):2×TaqMan Probe qPCR Mix 10μL,上游引物(10μmol/L)0.8μL,下游引物(10μmol/L)0.8μL,探针(5μmol/L)0.4μL,DNA模板2μL,无酶水6μL。空白对照以无酶水替代模板,阴性对照以非目标物种DNA为模板。

反应程序:预变性95℃ 30s;扩增阶段40个循环(95℃ 5s,60℃ 30s,荧光信号采集于60℃阶段);溶解曲线分析(60℃→95℃,升温速率0.1℃/s)。

4、仪器性能验证

特异性验证:以目标物种与非目标物种DNA为模板,检测荧光信号,判断是否存在交叉反应(Ct值>38或无扩增为阴性)。

灵敏度验证:将目标物种标准质粒(浓度10~10¹copies/μL)梯度稀释,检测最低检出浓度,分析Ct值与浓度的线性关系(R²≥0.99为合格)。

重复性验证:对同一标准品进行3次平行实验(批内重复),连续3天检测(批间重复),计算CV值(CV<5%为合格)。

实际样本检测:对100份市场盲样(宣称“纯牛肉丸”“进口三文鱼”等)及50份检疫截留样本进行检测,与对照设备荧光定量PCR仪的结果比对,计算准确率。

二、结果与分析

(一)特异性结果

博清生物荧光定量PCR仪对目标物种(牛肉、三文鱼、西洋参)均产生明显荧光扩增曲线(Ct值22~28),非目标物种(猪肉、鳕鱼、人参)及空白对照均无扩增(Ct值>38),特异性达100%。表明该仪器可通过特异性引物-探针体系,精准区分目标物种与干扰物种,避免假阳性。

(二)灵敏度结果

目标物种标准质粒浓度在10¹~10copies/μL范围内,Ct值与浓度呈良好线性关系(R²=0.998~0.999),最低检测限为10¹copies/μL。该灵敏度可满足微量掺假检测需求(如牛肉中掺5%以下马肉)及检疫中低浓度样本(如昆虫卵、微量组织)的识别。

(三)重复性结果

批内重复实验中,各浓度标准品的CV值为0.8%~1.5%;批间重复实验中,CV值为1.2%~1.8%,均小于2%。表明博清生物仪器的检测稳定性优异,数据可靠性高,可满足实验室常规检测的重复性要求。

(四)实际样本检测结果

100份市场盲样中,博清生物仪器检出8份掺假样本(如“牛肉丸”掺猪肉、“西洋参”掺人参),与进口仪器检测结果完全一致,准确率100%;50份检疫截留样本中,检出3份携带外来物种(如木材中检出天牛卵DNA),准确率96%(2份因样本DNA降解导致假阴性,进口仪器同样未检出)。整体实际样本检测准确率达98%,且单轮反应耗时1.5小时,较传统PCR(3~4小时)效率提升50%以上。

三、讨论

本研究证实,博清生物荧光定量PCR仪在物种鉴定中具备“三高一快”优势:

(一)高特异性:基于保守基因的引物-探针设计,结合仪器精准的温度控制(温控精度±0.3℃),有效避免交叉反应,解决了“近缘物种难区分”的问题(如牛肉与马肉、西洋参与人参)。

(二)高灵敏度与重复性:最低检测限达10¹copies/μL,可检测微量掺假或低浓度检疫样本;CV值<2% 的稳定性,确保不同批次、不同操作人员的检测数据一致,符合实验室质量控制要求。

(三)高效率:1.5小时完成单轮检测,且仪器支持96孔板同时运行,可满足批量样本筛查需求(如食品企业原料验收、海关集中检疫),较传统方法大幅缩短检测周期。

与进口仪器相比,博清生物仪器还具有明显的成本优势:仪器采购成本降低40%~50%,适配国产试剂(价格仅为进口试剂的1/3),且售后响应时间<24小时,更适合基层实验室及中小企业推广应用。

本研究仍存在局限:目前仅验证了12种常见物种的检测体系,未来需扩展更多物种(如珍稀动物、外来入侵植物)的引物-探针库;针对高脂肪、高色素样本(如动物内脏、深色中药材)的DNA提取干扰,需进一步优化前处理方法。后续可结合多重qPCR技术,实现“一次反应检测多种物种”,进一步提升检测效率。

博清生物科技(南京)有限公司研发的荧光定量PCR仪在食品安全物种掺假检测与动植物检疫物种鉴定中,表现出高特异性、高灵敏度、高重复性与高效率的综合性能,且成本可控、操作便捷。该仪器可作为国产替代方案,广泛应用于食品生产企业、市场监管部门、海关检疫机构等场景,为保障食品安全与生态安全提供有力的技术支持。


▸文章来源:http://www.boqinglab.com


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